本系十分重視與國內外學術界之交流，除短期邀請海內外學者蒞校演講外，亦藉由積極自籌款項，長年舉辦各種國際學術研討會，會議主題涉及科學史、臺灣史和中外關係等重要學術議題，加強了本系與國內外學術界的互動，亦提升本系師生之學術視野。三十餘年來，計舉辦學術會議多次，並出版論文集，深獲學界好評。

2022.06.06-06.07  2024淡水學國際學術研討會：船舶、海外華人、社會發展

2023. 4. 22「宋代政經社會與史料分析」學術研討會

2022.07.19~20  2022淡水學國際學術研會  產業與社會

2022.07.02~03 第四屆馬來西亞華人民俗研究：台灣與馬來西亞的比較視野國際學術工作坊

2021.05.07 第七屆海峽兩岸「宋代社會文化」學術研討會

*2020 第十四屆唐代文化國際學術研討會

2019「近現代東亞跨界活動與社會變遷」學術研討會剪影

*2019鄭芝龍國際學術研討會場剪影

◎2017淡水學國際學術研討會會場剪影。

◎2014淡水學暨區域社會史國際學術研討會會場剪影。

◎2011區域社會史學研討會會場剪影。

◎第五屆淡水學研討會會場剪影。

現將所舉辦之會議成果，芹獻於下：

• 109學年度與中國文化大學史學系合辦"第七屆海峽兩岸宋代社會文化學術研討會"。
• 109學年度與國立台北大學人文學院合辦"第十四屆唐代文化國際學術研討會"。
• 108學年度與台灣歷史學會、（日本）台灣史研究會，合辦「近現代東亞跨界活動與社會變遷」學術研討會。
• 107學年度主辦〈2019鄭芝龍國際學術研討會-鄭芝龍的海洋時代〉
• 106學年度主辦〈2017淡水學國際學術研討會-港口、船舶與貿易〉
• 103學年度舉辦〈2014淡水學際社會區域史國際學術研討會〉
• 100學年度主辦〈區域社會史學術研討會〉
• 99學年度主辦〈第五屆淡水學國際學術研討會〉
• 95學年度主辦〈第四屆淡水學國際學術研討會〉（已出版論文集）
• 93學年度主辦〈第三屆淡水學學術研討會：清法戰爭〉（已出版論文集）
• 90學年度主辦〈第二屆淡水學學術研討會：歷史、生態、人文〉（已出版論文集）
• 89學年度主辦〈世界華人科學史學術研討會〉（已出版論文集）
• 87學年度主辦〈淡水學學術研討會：過去、現在、未來〉（已出版論文集）
• 85學年度主辦〈臺灣史學術研討會：臺灣開發史〉（已出版論文集）
• 83學年度主辦〈臺灣史國際學術研討會：社會、經濟與墾拓〉（已出版論文集）
• 82學年度主辦〈中國政治、宗教與文化關係國際學術研討會〉（已出版論文集）
• 81學年度主辦〈中國與亞洲國家學術研討會〉（已出版論文集）
• 80學年度主辦〈第二屆中外關係史國際學術研討會〉（已出版論文集）
• 79學年度主辦〈第二屆中國政教關係史國際學術研討會〉（已出版論文集）
• 78學年度主辦〈中外關係史：思想與文物交流國際學術研討會〉（已出版論文集）
• 75學年度主辦〈中國近代政治與宗教關係國際學術研討會〉（已出版論文集）